Los módulos de aplicaciones de la serie MDO3000 de Tektronix son productos independientes que se pueden adquirir en el momento de la compra inicial de MDO3000 o posteriormente. El módulo de activación y análisis serie para el sector informático MDO3COMP permite la activación de información a nivel de paquete en bus de RS-232/422/485/UART, así como herramientas de análisis como vistas digitales de la señal, vistas de bus, decodificación de paquete, herramientas de búsqueda y tablas de decodificación de paquete con información de registro temporal.
Los módulos de aplicaciones de la serie MDO3000 de Tektronix disponen de licencias que pueden transferirse entre un módulo de aplicaciones y un osciloscopio. La licencia puede estar incluida en el módulo, permitiendo la transferencia del mismo de un instrumento a otro. La licencia también puede estar incluida en el osciloscopio, lo que permite la extracción del módulo y su almacenamiento en un lugar seguro. La licencia puede volver a transferirse al módulo para su uso en otro osciloscopio MDO3000. La transferencia de la licencia a un osciloscopio y la extracción del módulo hacen posible el uso de más de dos aplicaciones simultáneamente.